0章　日本列島のはじまり
斎藤成也(国立遺伝学研究所 名誉教授・特任教授)
1章　縄文時代を「掘る」ーーどうやって考古学者になり、なぜ墓をテーマに研究することになったかーー
山田康弘(東京都立大学 人文社会学部教授)
コラム　伊川津貝塚の母子DNA解析
太田博樹(東京大学大学院 理学系研究科生物科学専攻教授)
2章　お酒に弱い遺伝子とウンチの化石のゲノムから何がわかるか
太田博樹(東京大学大学院 理学系研究科生物科学専攻教授)
3章　アズキはどこで生まれたのかーー植物遺伝学で読み解く縄文時代の食文化ーー
内藤 健(農研機構 遺伝資源研究センター上級研究員)
コラム　ウルシの過去・現在・未来
菅 裕(県立広島大学 生物資源科学部教授)
4章　日本列島人はどこから来たのか
神澤秀明(国立科学博物館 人類研究部研究主幹)