※シリーズ全4巻刊行予定。歴史的に日本列島に居住してきた人類集団「ヤポネシア人」の起源と発展の歴史を、遺伝学・考古学・言語学などの文理融合研究によって紐解くシリーズ書。第1巻では現代のヤポネシア人を遺伝学の観点から解説。
続巻　2巻「ヤポネシアの古代人ゲノム」、3巻「ヤポネシアの動植物ゲノム」、4巻「ヤポネシアの考古と言語」

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　1　「内なる二重構造」モデルの検証〔斎藤成也〕
　　1.1　置換説、混血説、変形説
　　1.2　二重構造モデル
　　1.3　三段階渡来説
　　1.4　「内なる二重構造」モデル
　2　二重構造モデルの検証〔長田直樹〕
　　2.1　埴原和郎の二重構造モデル
　　2.2　東アジアにおける集団史の概観
　　2.3　二重構造モデルの発展形
　3　ヤポネシア人ゲノムの多様性〔大橋　順〕
　　3.1　日本人集団の遺伝的構造
　　3.2　縄文人由来変異
　4　ヤポネシア人のY染色体多様性〔佐藤陽一〕
　　4.1　Y染色体
　　4.2　ヤポネシア人のY染色体ハプログループ
　5　ゲノム規模SNPデータで探る地域性〔鈴木留美子〕
　　5.1　地域区分
　　5.2　全体の主成分分析プロット
　　5.3　五畿八道
　　5.4　海岸線
　　5.5　アクセント
第�局堯仝渋絅筌櫂優轡⊃優殴離爐�ら見た地域多様性
　6　東アジア人のゲノム構造〔河合洋介〕
　　6.1　東アジア人はどこからきたのか
　　6.2　日本人はどこからきたのか
　　6.3　現代日本人のゲノム解析
　　6.4　大規模なゲノム解析から見る日本人のゲノム構造
　　6.5　日本人集団の人口の変動
　　6.6　おわりに
　7　九州ヤマト人のゲノム〔三嶋博之、中岡博史、河村優輔、細道一善、井ノ上逸朗、吉浦孝一郎〕
　　7.1　試料収集態勢
　　7.2　試料の内訳
　　7.3　九州ヤマト人の核ゲノム解析
　　7.4　九州ヤマト人のHLA解析
　8　先史琉球とゲノム研究〔木村亮介〕
　　8.1　琉球の地理
　　8.2　考古学に見る先史の琉球と周辺地域との交流
　　8.3　ゲノム研究に見る琉球人集団の形成
　　8.4　今後の展望
　9　宮古諸島人のゲノム解析〔松波雅俊〕
　　9.1　宮古諸島の地理と歴史
　　9.2　宮古諸島の遺伝背景
　　9.3　宮古諸島の人々の由来
　　9.4　残された謎と応用的側面
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　10　ヤポネシア人の寒冷適応能〔中山一大〕
　　10.1　はじめに
　　10.2　ヒトの寒冷適応能と褐色脂肪組織
　　10.3　ヤポネシア人の熱産生能多様性に寄与する遺伝子
　　10.4　自然選択の痕跡を残す遺伝子は熱産生能と関連するか?
　　10.5　寒冷適応に関係した他の形質の多様性
　　10.6　おわりに
　11　SNP以外のゲノム変化〔藤本明洋〕
　　11.1　ヒトゲノムの多型
　　11.2　マイクロサテライトの遺伝的多様性
　　11.3　構造異常
　　11.4　今後の展望
　12　ピロリ菌のゲノム解析〔山岡吉生〕
　　12.1　ピロリ菌の病原因子CagAを用いた解析
　　12.2　multi-locus sequence typing(MLST)解析
　　12.3　次世代シークエンサーを用いた解析
　　12.4　おわりに
索　引