【目次】
第1部　近世長崎キリシタン六十年の歴史―全員キリシタンから全員仏教徒へ―
　第一章　長崎はじまりの三十年間―大村領から教会領、そして秀吉領へ
　第二章　徳川初期の長崎キリシタン
　第三章　宣教師・同宿・宿主が殺される時代の到来
　第四章　キリシタンであるだけで罰せられた三年間
　第五章　最後の結末とその後の長崎
第2部　附考　キリスト教会の瓦―長崎と鹿児島の花形十字文軒丸瓦を中心として―
　第一章　キリシタン墓碑の花形十字文と軒丸瓦の花形十字文の分類
　第二章　長崎の教会の年代と各教会の瓦葺年代
　第三章　長崎の教会の位置と花形十字文軒丸瓦の出土地
　第四章　長崎における花形十字文軒丸瓦が語るもの
　第五章　鹿児島城二之丸出土の花形十字文軒丸瓦
　第六章　島津藩主の姑カタリーナの信仰
　第七章　組み合う軒平瓦など